Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms