Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms