Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms