Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms