Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms