Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms