Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms