Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO28Q9NVF7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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