Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE7BQ9NP56 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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