Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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