Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms