Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms