Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms