Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms