Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CNTNAP3Q9BZ76 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CNTNAP3Q9BZ76 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CNTNAP3Q9BZ76 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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