Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms