Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXCL13-201ENST00000286758 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SAA2-203ENST00000526900 687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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