Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms