Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RSG1Q9BU20 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms