Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C2orf88Q9BSF0 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms