Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms