Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms