Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms