Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms