Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX18Q96RF0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms