Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms