Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms