Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAMP1Q96JM3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAMP1Q96JM3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAMP1Q96JM3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAMP1Q96JM3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAMP1Q96JM3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAMP1Q96JM3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAMP1Q96JM3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAMP1Q96JM3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAMP1Q96JM3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms