Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms