Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35B4Q969S0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms