Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms