Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms