Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms