Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms