Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.33■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms