Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms