Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF3Q86WH2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF3Q86WH2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms