Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1Q7Z7E8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms