Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00299Q6ZSB3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms