Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms