Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms