Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms