Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms