Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms