Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms