Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms