Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL38Q2WGJ6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms