Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETM2Q2VYF4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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