Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms