Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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